De aanvallers drongen het complex in de deelstaat Jonglei binnen. De VN vrezen dat daarbij slachtoffers zijn gevallen.
De aanvallers zouden rebellen van de Nuer-stam zijn, meldde de BBC. In de basis hadden duizenden burgers hun toevlucht gezocht voor het geweld in het land.
Bij gevechten tussen etnische groepen in Zuid-Sudan zijn de afgelopen dagen al honderden doden gevallen.