De kustwacht heeft 13 lichamen geborgen, zo meldden Australische media zondag. De andere opvarenden worden nog vermist.
De boot kapseisde zo'n 120 kilometer ten noordwesten van Christmas Island. Er zouden voornamelijk mannen aan boord zijn geweest, maar ook enkele vrouwen en kinderen. De boot was woensdag nog gesignaleerd door een vliegtuig van de luchtmacht, die toen op het dek 55 mensen telde.
Een marineschip dat vervolgens op zoek ging om het schip te onderscheppen kon het niet meer vinden, waarna de zoektocht begon. Vanuit de lucht werd vrijdag onder water nog de romp van het schip gesignaleerd.
De identiteit van de opvarenden is niet bekend. Sinds 2007 hebben meer dan 45.000 vluchtelingen hun toevlucht gezocht in Australië. De meesten komen uit Afghanistan, Iran en Irak. Jaarlijks overlijden veel vluchtelingen bij hun poging om via Indonesië of Sri Lanka per boot in Australië te komen.